伴随诊断一站式解决方案-产品介绍-AG真人国际致源

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肿瘤新抗原预测

肿瘤新抗原又称为肿瘤特异性抗原（Tumor-specificantigen，TSA），是由肿瘤细胞产生的体细胞突变，且仅表达于肿瘤细胞，有比较强的肿瘤特异性和较高的免疫原性。因为其诱导自身免疫疾病的风险较低，肿瘤新抗原为免疫治疗提供了新的方向，成为现阶段的研究热点。 AG真人国际致源依托国际领先的测序平台及生物信息分析平台成功推出 NovoNeoantigen 肿瘤新抗原预测服务，通过对肿瘤组织与正常对照样本的全外显子组测序（WES）数据和肿瘤组织的转录组测序（mRNA-Seq）数据进行分析，实现对肿瘤新抗原的精准预测。

全面的结果分析

NovoNeoantigen 基于配对样本的全外显子组数据和肿瘤组织的 mRNA-seq 数据，对三种变异类型（SNV，InDel and Fusion）的变异结果进行进一步分析，并得到肿瘤突变负荷（TMB）、SNV phasing、HLA 分型和抗原亲和性的结果，最终筛选预测肿瘤特异性抗原。

可靠的性能验证

NovoNeoantigen 通过对已知基因突变引起的新抗原数据进行验证，保证可靠的数据分析。

极致的周期体验

NovoNeoantigen 可灵活提供两种交付周期：即从样本接收到分析结果的全流程服
务，只需 24 个工作日；从客户提供的原始数据到分析结果的纯分析服务，只需 6 个工作日。

产品参数

测序策略	NovaSeq 6000 , PE150
样本要求	• FFPE 切片：≥ 10 张 (4 μm)，单张面积 ≥ 25 mm ² • FFPE 蜡块：≥ 1 块 • 新鲜组织：≥ 300 mg • 血液：≥ 2 ml
Raw Data 要求	• 全外显子组测序：肿瘤样本建议测序深度 ≥ 200 X 正常样本建议测序深度 ≥ 100 X • RNA 测序： FFPE 肿瘤样本测序数据量 ≥ 12 G 新鲜组织样本测序数据量 ≥ 9 G • 数据格式： FASTQ 和 BED 文件
交付周期	• 样本接收到交付分析结果：24 个自然日 • 原始数据到交付分析结果：6 个自然日

生信流程

● 通过 WES 数据分析准确预测所有的 HLA-I 型分子和 6 种 HLA-II 型分子（包括 DQA1, DQB1, DPA1, DPB1, DRB1, and DRB5）； ● 结合 WES 和 mRNA-Seq 数据检测 SNV、InDel 和 Fusion 三种变异类型和相应基因表达水平，同时在 SNV 预测的过程加入了 phasing 方法，提高预测灵敏度，并可提供TMB 的结果； ● 根据数据分析结果预测肿瘤特异性新抗原。