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泛基因组测序—探秘物种间潜在密码
泛基因组包括核心基因组(Core genome)和非必须基因组(Dispensable genome)。其中,核心基因组由所有样本中都存在的序列组成,一般与物种生物学功能和主要表型特征相关,反映了物种的稳定性; 非必须基因组由仅在单个样本或部分样本中存在的序列组成,一般与物种对特定环境的适应性或特有的生物学特征相关,反映了物种的特性。针对不同但又相互关联的个体材料进行较高深度测序,单独进行 组装,构建泛基因组图谱,以期获得该物种完整的遗传信息。应用方向
AG真人国际优势
1.顶级研究实力
自2014年AG真人国际致源在Nat Biotechnol上发表大豆泛基因组研究成果以来,AG真人国际致源的基因组合作项目遍布全球,引领基因组研究潮流。泛基因组研究覆盖样本更为广泛、研究更为全面和彻底,并具有各自的数据挖掘亮点,为大范围的物种进化和育种研究提供了坚实有力的支撑,具有重要意义。50人
分析团队7年
项目经验1000+
结题项目1对1
项目服务2.科学方案设计
从材料选取,建库测序,到数据分析,科学、缜密的设计保障高质量研究成果。Type | 文库类型 | 测序平台 | 测序深度 | 用途 |
---|---|---|---|---|
二代测序 | 350bp小片段 | Illumina Novaseq | 50× | Survey分析,评估基因组大小和复杂程度 |
三代测序 | 三代HiFi文库 | Pacbio Sequel IIe/Revio | HiFi数据30× | 构建基因组contig,搭建骨架 |
Hi-C | Hi-C文库 | Illumina Novaseq | 100× | 辅助组装至染色体水平 |
转录组测序 | 三代全长转录组 | Pacbio Sequel IIe(II) | 60G | 辅助注释 |
3. 全面信息分析
综合变异检测、泛基因组特征分析、比较基因组分析、SV分析、图基因组构建与关键变异展示,锁定研究潮流,呈现全面结果。信息分析
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